Жданьков родился 12 апреля 1947 г в Петропавловске-Камчатском. В 1970 г окончил Московский инженерно-экономический институт им Орджоникидзе. Кандидат юридических наук, генерал-полковник. Последние годы работал в органах государственной безопасности, в частности, по информации ПРАЙМ- ТАСС, занимал должности руководителя Контрольной службы ФСБ РФ, заместителя директора ФСБ России, руководителя департамента по защите конституционного строя и борьбе с терроризмом.
31 июля 2001 г Жданьков руководил операцией по освобождению заложников из захваченного автобуса в Ставрополье. Предполагается, что Жданьков будет в Счетной палате РФ вести направление, находившееся ранее в ведении Олега Сафонова, полномочия которого были досрочно прекращены Госдумой 7 марта в связи с переходом на другую работу. Председатель Счетной палаты Сергей Степашин, присутствовавший на заседании, охарактеризовал Жданькова как "абсолютно достойного, честного, порядочного человека".