Мутко избрали президентом РФС осенью 2015 года сроком на один год, в 2016-м его переизбрали еще на четыре года. В декабре 2017 года им было принято решение временно оставил должность, и исполняющим обязанности главы РФС стал Александр Алаев.
Кадровые перестановки стали следствием дисквалификации, наложенной на Мутко МОК в связи с допинговыми скандалами в российской сборной.
Решение Мутко покинуть должность президента РФС проводит черту между прошлым и будущим современного российского спорта. Период правления в нем Мутко запомнится не только яркими победами и проведением крупнейших международных турниров, но и не менее резонансными допинговыми разбирательствами, которые в конечном счете и заставили его покинуть профильную отрасль.
Пресс-секретарь президента РФ Дмитрий Песков поделился мнением об уходе Виталия Мутко с поста президента РФС.
«Мы высоко ценим вклад Виталия Мутко и желаем успехов новому руководителю», — заявил Песков.
«Хочется поблагодарить Виталия Леонтьевича Мутко за все те усилия, которые он предпринял для достижения результатов в отечественном футболе. Я надеюсь, что новый руководитель РФС, который будет избран на полностью свободном голосовании, поднимет футбол в России на новый уровень», — заявила, в свою очередь, вице-премьер Ольга Голодец, которая теперь курирует вопросы спорта в стране.
Новый постоянный президент организации будет выбран во второй половине февраля, когда состоится конференция РФС. Главным кандидатом считается председатель совета директоров «Зенита» Александр Дюков, который в среду присутствовал на историческом заседании исполкома РФС, однако на тему предстоящих выборов в кругу коллег не высказывался.