Багаури подозревается грузинской стороной в сотрудничестве со спецслужбами России и Южной Осетии. Сам Багаури во время допроса подтвердил факт сотрудничества с российской разведкой.
По утверждению грузинского МВД, Багаури передавал России информацию об обороноспособности страны, а также снабжал Россию схемами грузинских стратегических объектов. На этот раз шпион готовил в Грузии провокацию.
Багаури якобы должен был добыть информацию о беженцах из Чечни в Панкисском ущелье и с их помощью осуществить теракт с целью ликвидации президента самопровозглашенной республики Южной Осетии Эдуарда Кокойты. Ответственность за теракт предполагалось, по версии грузинской стороны, возложить на спецслужбы Грузии.