Согласно докладу по результатам проверки, опубликованному на интернет-сайте службы, в ходе проверок выявлены финансовые нарушения при расходовании 513,0 млн рублей средств федерального бюджета и 2,655 млрд рублей средств внебюджетных фондов. В том числе выявлено нецелевое использование средств в сумме 39,8 млн рублей, неэффективное использование средств и оборудования в размере 457,3 млн. рублей, переплаты и другие расходы, нанесшие материальный ущерб на 85,5 млн рублей, недопоступление платежей во внебюджетные фонды на 0,2 млн рублей, другие финансовые нарушения на 2 млрд 585,2 млн рублей.
Также были выявлены факты нарушений законодательства РФ при осуществлении закупок товаров, работ и услуг для государственных нужд и прочие нарушения.