В министерстве Алексея Улюкаева считают, что главной пострадавшей стороной в случае принятия инициативы Минфина станут нефтяные компании. Последние не смогут минимизировать отчисления по налогу на прибыль с учетом потерь, которыми сопровождался этап разведки месторождений. Проект финансового ведомства предусматривал внесение корректив в статьи Налогового кодекса РФ, регламентирующие налогообложение организаций, которые находятся в стадии реорганизации. Сейчас, считают в министерстве, отечественные компании занижают размер налога на прибыль за счет присоединяемых компаний.
Согласно предложенным правилам, разрешается переносить только те убытки, которые были понесены участвующими в присоединении компаниями на этапе, когда поглощаемая и поглощающая структуры были взаимозависимыми. По нынешней же редакции Налогового кодекса, при присоединении компаний учитываются и убытки на прошлые годы. Чаще всего присоединение таких структур происходит на рынке финансовых организаций, а также в топливно-энергетическом комплексе. Свою позицию в ведомстве Антона Силуанова подкрепляют подсчетами Казначейства. Там отметили, за первые 9 месяцев нынешнего года поступления от налога на прибыль составили всего 389 млрд рублей, что на 15 млрд рублей меньше прошлогоднего показателя.
Однако в экономическом ведомстве сочли, что предложение Минфина не в полной мере обосновано, а в случае принятия — повлечет чрезмерное административное давление на бизнес и вынудит коммерческий сектор нести необоснованные расходы. В заключении министерства отмечается, что в наибольшей мере могут пострадать добросовестные предприятия, которые присоединяют убыточные структуры в интересах развития рынка, либо вывода таких организаций на кредитоспособный уровень.
А в Российском союзе промышленников и предпринимателей добавляют, законопроект финансового ведомства противоречит интересам добывающих компаний. В данном секторе общепринятой является практика, при которой разведкой месторождений занимаются специально созданные структуры. Они неизбежно несут убытки. Однако, когда организации добиваются защиты проекта в Госкомиссии по полезным ископаемым, и добыча на месторождении становится разрешенной, организацию-разработчика выкупают крупные игроки рынка. Если правило учета убытков при вычислении налоговой базы будет отменено, компании потеряют интерес к разведке новых месторождений.